Les filtres secondaires sont nécessaires au fonctionnement d'un système multicyclonique ICM. Ils assurent la puissance d'aspiration nécessaire et doivent être adaptés à la perte de charge de l'ensemble du système. Le nettoyage automatisé des filtres ainsi que le contrôle de la pression différentielle garantissent le maintien de la puissance d'aspiration.